Visto che su "Team Foundation Service" non si dispone di una console di amministrazione, non è ovviamente possibile utilizzarla per eliminare un progetto hostato.
Quindi, per eliminare un Team Project da una Collection di TFService bisogna usare il comando "tfsdeleteproject.exe" dall CLI:
tfsdeleteproject /collection:https://<nome collection>.VisualStudio.com/DefaultCollection <"Nome Progetto">
Per ulteriori informazioni, vedere: http://social.msdn.microsoft.com/Forums/en-US/TFService/thread/81997146-a64f-43fb-9952-57d71542cd11